O Dr. Arindam Ghatak, da Universidade de Viena, realizou perfis proteômicos de alto rendimento da variedade de batata Desiree para obter uma imagem abrangente e imparcial das alterações no proteoma da batata (a soma de todas as proteínas presentes) em resposta a várias situações de estresse.
As plantas foram cultivadas em um experimento piloto na PSI, com sede na República Tcheca, parceira do projeto.
Todas as proteínas foram isoladas e pré-fracionadas para esse intrincado exame antes de serem digeridas e submetidas à espectrometria de massas, que permite a detecção de centenas de proteínas diferentes em uma única amostra e, adicionalmente, a quantificação de sua abundância. O software Proteome Discoverer foi então usado para analisar os dados coletados (Thermo, Germany). As proteínas foram identificadas usando o banco de dados curado interno da Solanum (gerado pelo NIB Institute, Ljubljana, Eslovênia).
Da colheita 1 (um dia após o estresse) e da colheita 3 no total, foram encontradas 10341 proteínas (8 dias após o estresse). Na colheita 1, o estresse de encharcamento foi onde a maior modulação do proteoma foi observada. Aqui, as proteínas envolvidas na sinalização, metabolismo lipídico e ligação ao RNA mostraram atividade aumentada em comparação com os controles. Da mesma forma, durante o estresse térmico em comparação aos controles, as proteínas envolvidas na fotossíntese e no metabolismo secundário foram aumentadas, revelando o mecanismo de resposta ao estresse do proteoma.
Em linha com a safra 1, a safra 3 também mostrou que o estresse por alagamento, calor e os efeitos combinados de calor e seca foram os estresses que identificaram a regulação proteômica mais forte. Em comparação aos controles e outros estresses, a sinalização 14-3-3 foi elevada sob o estresse de alagamento, que afeta proteínas classificadas como pertencentes à categoria funcional do metabolismo energético.
“Com base na identificação preliminar, o alagamento e o estresse térmico demonstraram a regulação mais forte no nível do proteoma em comparação com outros estresses. No entanto, será interessante observar o proteoma da fase de recuperação em comparação com outros pontos de colheita, especialmente durante o estresse hídrico. Mais mineração de dados está em andamento para obter informações detalhadas sobre os mecanismos de resposta ao estresse das plantas e a fase de recuperação na variedade de batata Desiree”, escreveram os cientistas.
O projeto Horizon 2020 EU Accelerated Development of multiple-stress tolerAnt PoTato (ADAPT), no qual a Europatat participa, visa desenvolver novas estratégias para tornar as batatas adequadas para as desafiadoras condições de crescimento do futuro.
Um dos principais objetivos do projeto é investigar as alterações morfológicas, fisiológicas, bioquímicas e moleculares da batata em resposta ao estresse único e combinado de calor, seca e alagamento, aplicando fenotipagem de alto rendimento e tecnologias OMICS (genômica, transcriptômica, proteômica ou metabolômica).
Uma fonte: https://www.potatobusiness.com