Doenças bacterianas das plantas

Resumo

O BBSRC, também em nome do Departamento de Meio Ambiente, Alimentação e Assuntos Rurais (Defra), do Conselho de Pesquisa do Ambiente Natural (NERC) e do governo escocês, anuncia um apelo à pesquisa para abordar as ameaças à saúde vegetal e à biossegurança do Reino Unido causadas por doenças bacterianas. São convidadas propostas para estudos multidisciplinares e interdisciplinares de patógenos bacterianos de plantas e suas interações com plantas hospedeiras, invertebrados vectorse o ambiente mais amplo.

Esta chamada é a segunda fase de um programa mais amplo sobre doenças de plantas bacterianas apoiado pelo Fundo de Prioridades Estratégicas (SPF) do UK Research and Innovation (UKRI). Ele irá complementar o trabalho do consórcio BRIGIT recentemente estabelecido com foco em Xylella fastidiosa financiando estudos de uma variedade de doenças.

Contexto

Há uma preocupação crescente com as ameaças potenciais e existentes à saúde e à biossegurança das plantas (incluindo as árvores) do Reino Unido devido à disseminação mais ampla e à ocorrência mais comum de doenças bacterianas emergentes e indígenas. Os factores que contribuem incluem alterações ambientais e um maior movimento de plantas ou materiais vegetais potencialmente contaminados no comércio. Esses patógenos (e seus invertebrados vectors) ameaçam a produção agrícola, a silvicultura, a horticultura comercial e recreativa, bem como as florestas e a biodiversidade mais ampla no ambiente mais amplo. Têm o potencial de causar impactos económicos, ambientais e sociais generalizados e graves nas paisagens e nos ecossistemas, tanto rurais como urbanos.

Os fitopatógenos bacterianos são diversos e causam muitos tipos de doenças. Sua transmissão pode ser pelo ar, pelo solo ou por invertebrados. vectorS. Quando introduzidos em novas áreas, a sua propagação é imprevisível, mas muitas vezes altamente invasiva. Eles são difíceis de controlar com produtos químicos e, ao contrário de muitos outros patógenos de plantas, frequentemente possuem um grande número de hospedeiros potenciais.

A preocupação é reforçada pela relativa escassez de pesquisas sobre fitopatógenos bacterianos, agravada pela disponibilidade de capacidade científica limitada e capacidade de responder aos desafios que eles representam. Os patógenos geralmente são difíceis de estudar: a infecção pode ser latente e sem sintomas, enquanto alguns patógenos são “inculturáveis” fora de seus hospedeiros vegetais.

O Registro de Riscos para a Saúde Vegetal do Defra contém informações sobre muitos patógenos bacterianos, e mais patógenos estão sendo adicionados à medida que se tornam um risco. Este convite não se concentra exclusivamente nas doenças bacterianas incluídas no registro, mas os candidatos podem considerá-lo uma fonte de informação útil.

Propósito

O objetivo deste convite à apresentação de propostas é apoiar a investigação multidisciplinar e interdisciplinar para compreender e informar a gestão das ameaças à saúde das plantas no Reino Unido provenientes de doenças bacterianas com impactos potencialmente graves nas plantas cultivadas ou no ambiente natural. Tem como objetivo atender às necessidades dos formuladores de políticas e profissionais, explorando oportunidades científicas para abordar lacunas no conhecimento da biologia e epidemiologia dessas doenças, a fim de otimizar as respostas para combatê-las.

O convite também visa aumentar a capacidade e a capacidade de investigação sobre doenças bacterianas, reunindo conhecimentos especializados em fitopatologia com tecnologias genómicas e outras de ponta, e investigação noutras disciplinas. Quando apropriado, esta investigação deverá basear-se em abordagens relevantes de outros campos, particularmente num contexto ambiental mais amplo, para compreender as interacções entre agentes patogénicos, os seus hospedeiros e vectorse ecossistemas mais amplos.

O portfólio de projetos financiados será gerenciado ativamente para promover a troca de conhecimento - entre projetos e com as partes interessadas - a fim de explorar oportunidades de sinergia e garantir a relevância para as necessidades do usuário.

Objetivo

Esta chamada é a segunda fase de um programa mais amplo sobre doenças bacterianas de plantas apoiado pelo SPF, com contribuições adicionais do Defra e do governo escocês. Abrange todos os tipos de patógenos bacterianos (incluindo fitoplasmas) que afetam ou ameaçam plantas cultivadas ou outras plantas (terrestres ou aquáticas) (incluindo árvores) de importância e valor comercial, ambiental, social ou cultural no Reino Unido.

Compreender a biologia dos patógenos bacterianos e suas complexas interações com plantas hospedeiras, invertebrados vectorSe o ambiente mais amplo, as propostas terão de recorrer a conhecimentos especializados de uma variedade de disciplinas de investigação. Estes podem incluir bacteriologia, ecologia, entomologia, epidemiologia, genômica, modelagem, fitopatologia, ciências sociais e quaisquer outras áreas relevantes de pesquisa. Abordagens interdisciplinares inovadoras que integrem diferentes tipos de conhecimentos especializados seriam particularmente bem-vindas.

Além de ser cientificamente excelente, a pesquisa a ser financiada deve ser estrategicamente relevante para as necessidades dos usuários em potencial: governo, agências estatutárias, empresas, indústria e organizações não governamentais. Espera-se que as partes interessadas se envolvam na concepção e entrega de projetos para garantir sua relevância para a política e a prática.

Além disso, as propostas devem demonstrar como aumentariam a capacidade e a capacidade do Reino Unido de pesquisa sobre doenças de plantas bacterianas.

As propostas são convidadas para projetos que abordem desafios em um ou mais dos seguintes temas, mas estes não têm a intenção de ser prescritivos ou exclusivos:

Efeitos da mudança ambiental

Mudanças no ambiente e seu manejo provavelmente resultarão em mudanças na maneira como os patógenos bacterianos se propagam e afetam seus hospedeiros. Mudanças na temperatura, padrões de precipitação, CO₂ concentrações, inseto vector o comportamento, o uso da terra e o comportamento agrícola podem afectar a forma como o hospedeiro é exposto ao agente patogénico e, na verdade, se uma doença bacteriana se estabeleceria após chegar ao Reino Unido pela primeira vez. As aplicações para estudar os efeitos das mudanças ambientais nas doenças bacterianas ajudarão as partes interessadas a compreender e a preparar-se para as doenças bacterianas agora e no futuro.

Transferência entre hosts

Uma das maiores preocupações sobre algumas doenças bacterianas é a sua tendência para afectar uma gama particularmente ampla de plantas hospedeiras. Compreender não apenas a gama de hospedeiros de um patógeno, mas também como ele é capaz de afetar novos hospedeiros, pode nos dar conhecimento que pode ser usado para prevenir a infecção de outros hospedeiros. Compreender o papel do vectorOs agentes envolvidos na transmissão da doença e na infecção das plantas também serão fundamentais para desenvolver formas de reduzir os impactos destas doenças.

Fatores que afetam a patogenicidade

Para que uma doença bacteriana se alastre em uma planta hospedeira, a bactéria precisa encontrar o hospedeiro de uma forma que permita a infecção. As aplicações são bem-vindas para entender o ciclo de vida do patógeno e o que o torna patogênico, bem como entender como essa patogenicidade ocorre. Isso pode ter um papel a desempenhar, informando as partes interessadas sobre os riscos de infecção, inclusive de material vegetal importado.

Efeitos do solo / microbioma do solo

O solo pode desempenhar uma variedade de papéis na transmissão e estabelecimento de doenças bacterianas das plantas. As bactérias patogênicas podem viver no solo e infectar as plantas hospedeiras que ali crescem e, ao contrário dos patógenos que afetam as partes superiores das plantas, as bactérias do solo são difíceis de tratar. Além disso, as doenças podem ser propagadas por organismos que vivem no solo, como nemátodes e lesmas. As condições do solo, incluindo o microbioma do solo, também podem ter um efeito, mas pouca pesquisa foi feita nesta área, e aplicações para estudar o papel do solo nas doenças bacterianas das plantas são bem-vindas.

Compreender a resistência e suscetibilidade do hospedeiro

Os mecanismos pelos quais os hospedeiros vegetais resistem ao ataque de patógenos bacterianos foram estudados, mas nem sempre está claro por que uma espécie hospedeira será suscetível a uma doença bacteriana, enquanto outra espécie será amplamente resistente. Compreender a resistência do hospedeiro está dentro do escopo desta chamada, mas os pedidos focados principalmente em cultivar variedades de safras resistentes serão rejeitados.

A pesquisa a ser financiada deve estar dentro das atribuições do BBSRC e / ou NERC e deve incluir um elemento substancial de investigação biológica e / ou ciência ambiental. Mas, para garantir sua relevância para as partes interessadas e potencial de impacto, as propostas devem levar em conta os contextos econômicos e sociais dos desafios fitossanitários que visam abordar. Desde que estejam intimamente integrados a outros aspectos do trabalho proposto, os projetos também podem incluir elementos apropriados de análise econômica ou ciências sociais.

A primeira fase do programa de doenças de plantas bacterianas SPF é um corpo de trabalho multidisciplinar integrado de £ 5 milhões em Xylella fastidiosa pelo consórcio BRIGIT de instituições liderado pelo John Innes Center. Enquanto pesquisas adicionais sobre X. irritante não está excluída do presente convite, o trabalho proposto deve ser distinto e complementar do BRIGIT e de outros estudos existentes, incluindo os projetos XF-ACTORS e POnTE apoiados pelo programa Horizonte 2020 da União Europeia. As propostas devem demonstrar o valor agregado que proporcionariam por meio da sinergia com as atividades em andamento.

Espera-se que as propostas de pesquisa sobre as funções das bactérias nas doenças dos carvalhos se alinhem com as prioridades e se comprometam com a parceria da Action Oak. Defra se ofereceu para fornecer uma carta de apoio para propostas que atendam aos objetivos da Action Oak, entre em contato com Sarah Jeffery em info@actionoak.org com uma descrição de sua proposta para mais informações. 

A pesquisa sobre os seguintes tópicos foi excluída desta chamada:

• pesquisa sobre contaminação / deterioração bacteriana pós-colheita de safras
• pesquisa com o objetivo específico de permitir a criação comercial de plantas resistentes a determinados patógenos bacterianos
• pesquisas para compreender as interações entre as plantas e os patógenos bacterianos humanos e seus papéis na transmissão de doenças às pessoas.

Escala e duração do projeto

Estão disponíveis até £ 13 milhões, dependendo da qualidade das propostas recebidas, com o objetivo de apoiar uma carteira adequadamente ampla e equilibrada de até 20 projetos. As inscrições não devem exceder £ 2.5 milhões (a 100% de seu custo econômico total). Os financiadores têm como objetivo financiar uma carteira de projetos de tamanhos e áreas de enfoque mistos. Aplicações multidisciplinares em grande escala são bem-vindas, mas projetos menores e mais direcionados não são excluídos.

Os fundos podem ser solicitados por até três anos, e os projetos devem começar em 1º de maio de 2020.

Todos os projetos serão financiados a 80% de seu custo econômico total.

Reunião da cidade

Uma Reunião Geral foi realizada em 21 de junho para fornecer aos candidatos potenciais e partes interessadas a oportunidade de descobrir mais sobre os antecedentes da chamada e entender o que os financiadores esperam apoiar por meio dela. As apresentações foram feitas por Jon Knight, Nicola Spence, Saskia Hogenhout e Debbie Harding e estão disponíveis na seção 'Downloads'. 

Elegibilidade

A chamada está aberta a indivíduos elegíveis em organizações que normalmente são elegíveis para se candidatar a bolsas de pesquisa dos conselhos de pesquisa do UKRI. Aplicam-se os critérios de elegibilidade padrão do BBSRC e NERC, consulte downloads e NERC: Elegibilidade para bolsa de pesquisa.

Apenas para esta chamada: Os Estabelecimentos de Pesquisa do Setor Público (PSREs) com 10 ou mais pesquisadores com PhD (ou equivalente) podem se inscrever. Se os PSREs que desejam se inscrever não se inscreveram anteriormente para o financiamento do UKRI e não estão atualmente designados com o status de IRO, eles deverão preencher um formulário de elegibilidade (consulte: Pesquisa e Inovação do Reino Unido: Solicitação de elegibilidade para se inscrever na Pesquisa e Inovação do Reino Unido para financiamento de pesquisa) para garantir que eles tenham a capacidade de pesquisa necessária, sistemas e controles para gerenciar a pesquisa e o financiamento da concessão. Os candidatos PSRE devem entrar em contato plant.bacteria@bbsrc.ukri.org na primeira oportunidade para discutir seus interesses em se inscrever.

As inscrições que incluem o diretor ou co-investigadores que não são elegíveis para se inscrever para financiamento e / ou organizações inelegíveis serão rejeitadas.

As instituições de pesquisa no exterior podem ser parceiras colaborativas em projetos, mas não são elegíveis para receber financiamento direto sob a iniciativa. Propostas de bolsas de pesquisa não serão aceitas de instituições estrangeiras ou de candidatos do Reino Unido se as propostas contiverem solicitações de financiamento direto para co-candidatos estrangeiros (mas consulte a seção sobre subcontratação abaixo).

Organizações do setor privado, instituições de caridade e ONGs que não têm o status de IRO aprovado pelo UKRI podem participar como parceiros colaborativos, mas tais organizações não são elegíveis para se inscrever ou receber financiamento direto desta iniciativa (mas consulte a seção sobre subcontratação abaixo).

Em todos os casos de atividade colaborativa com organizações que não sejam as classes de instituições elegíveis listadas acima, tanto os candidatos quanto os colaboradores / parceiros do projeto devem estar cientes de quaisquer custos incorridos, diretos ou não, por colaboradores ou instituições colaboradoras (parceiros do projeto) em conexão com colaborações, não podem ser atendidas por meio desta iniciativa.

Mais orientações sobre a inclusão de colaboradores e parceiros do projeto estão disponíveis no guia de concessões do BBSRC (consulte a seção de downloads).

A subcontratação de aspectos do trabalho proposto a instituições não elegíveis para se candidatarem diretamente a financiamento, devido, por exemplo, à falta de especialização adequada em instituições elegíveis, é aceitável. No entanto, os candidatos precisam demonstrar que a participação de qualquer subcontratado forneceria acesso a recursos essenciais que não estão disponíveis em uma organização de pesquisa elegível do Reino Unido. Informações detalhadas sobre a subcontratação estão no BBSRC Grants Guide.

Horário

Pré-anúncio da chamada	4 Março de 2019
Lançamento da chamada	20 de maio de 2019
Reunião da cidade	21 de Junho de 2019
Prazo de inscrição	25 de Julho de 2019
Reunião de avaliação	Dezembro de 2019 (tbc)
Concessão de bolsas de pesquisa	Fevereiro de 2020 (tbc)

Existem restrições à duração deste programa de financiamento e todas as subvenções terão de começar em ou antes de 1 de maio de 2020.

Processo de inscrição e avaliação

As candidaturas a bolsas de investigação devem ser submetidas através do sistema Joint Electronic Submission (Je-S) dos conselhos de investigação e a sua avaliação será gerida pelo BBSRC. Os candidatos potenciais devem observar que os indivíduos e instituições elegíveis devem estar registrados no sistema Je-S para poderem se inscrever. Qualquer instituição ou indivíduo elegível que esteja considerando enviar uma proposta, mas não esteja atualmente registrado para usar o sistema, deve considerar o registro antecipado e entrar em contato com o Helpdesk Je-S (jeshelp@je-s.ukri.org ; 01793 444164).

Os candidatos devem entrar no Je-S e selecionar:

• Conselho: BBSRC
• Tipo de documento: Proposta Padrão
• Esquema: Padrão
• Chamada / Tipo / Modo: Programa de Doenças Bacterianas de Plantas Fase 2

Para esta chamada, será necessário um documento adicional 'Plano de Engajamento das Partes Interessadas'. Faça o upload para o seu aplicativo como tipo de anexo 'Outro anexo' no Je-S. Todos os outros documentos são exigidos de acordo com as inscrições padrão, no entanto, para esta chamada, o limite de páginas para o Caso de Suporte e Histórico deve ser de no máximo doze lados de A4 (compreendendo duas páginas de histórico e dez páginas do Caso para Apoio, suporte).

As inscrições devem ser enviadas antes das 16:00 BST do dia do prazo de inscrição. Não serão aceitas extensões de prazos. Recomendamos que você envie com bastante antecedência do prazo de inscrição.

Os critérios de avaliação das propostas serão os seguintes:

• Excelência científica
• Relevância para o escopo e propósito da chamada
• Impacto econômico e social
• Estratégia e relevância política
• Custo-benefício
• Potencial para construir capacidade e capacidade
• Envolvimento das partes interessadas
• Robustez e adequação do plano de gestão do projeto, em particular para a gestão de consórcios interdisciplinares.

Os financiadores tomarão a decisão final sobre os projetos a serem financiados com base nas recomendações do painel de avaliação. Os financiadores também levarão em consideração a cobertura geral e o equilíbrio do programa de trabalho que está sendo financiado.

Caminhos para Impacto

Os candidatos deverão preencher uma declaração 'Caminhos para o Impacto' como parte de sua inscrição; este é um requisito padrão dos pedidos de subvenção do Conselho de Pesquisa que é considerado como parte do processo de revisão por pares. Os parceiros financiadores desejam que os pesquisadores financiados por meio deste programa planejem um programa de engajamento das partes interessadas e troca de conhecimento que será implementado durante toda a vida do projeto. Os candidatos devem considerar cuidadosamente como o conhecimento e a experiência adquiridos com o projeto seriam disponibilizados aos formuladores de políticas relevantes e outras partes interessadas. Quaisquer outros tipos de impacto que possam surgir da pesquisa também devem ser incluídos. Por favor, veja Pesquisa e inovação no Reino Unido: caminhos para impactar.

Os candidatos devem observar que os custos associados à implementação de atividades de impacto específicas do projeto podem ser incluídos nos pedidos de subsídios. Os custos devem ser totalmente justificados. Os financiadores estão particularmente interessados ​​em ver as atividades de impacto que se estenderão além da duração da bolsa de pesquisa.

Envolvimento das partes interessadas

Além do documento Caminhos para o Impacto, os candidatos deverão apresentar um plano de engajamento das partes interessadas. Os financiadores estão ansiosos para ver o envolvimento ativo de grupos de partes interessadas relevantes em projetos, desde a concepção de projetos até a entrega da pesquisa e com as partes interessadas, em última análise, usando os resultados da pesquisa. O plano de engajamento das partes interessadas deve indicar quais partes interessadas irão / provavelmente se envolverão, como elas estarão envolvidas no projeto e como suas necessidades contínuas serão refletidas na entrega do projeto.

O plano de engajamento das partes interessadas será um anexo separado do documento Pathways to Impact e terá até duas páginas.

Jon Knight de AHDB ofereceu-se para atuar como intermediária a fim de fomentar colaborações entre os candidatos e as partes interessadas relevantes do setor; entre em contato. Jon.Knight@ahdb.org.uk para mais informações. 

Requisitos de financiamento e relatórios

O financiamento concedido sob a iniciativa será administrado pelo BBSRC. Ele estará sujeito aos termos e condições padrão do UKRI para bolsas de pesquisa (ver downloads), juntamente com requisitos específicos adicionais ou alternativos acordados em conjunto pelo BBSRC e seus parceiros de financiamento (por exemplo, relacionados a propriedade intelectual, gerenciamento e compartilhamento de dados, requisitos de relatórios, engajamento público ou interações com a parceria de financiamento).

Os projetos apoiados por meio dessa iniciativa terão duração de até três anos.

Os projetos serão financiados a 80% dos Custos Econômicos Totais (FEC) elegíveis, de acordo com a prática usual dos Conselhos de Pesquisa.

Os financiadores adotaram a política do UKRI sobre o acesso aberto aos resultados da pesquisa (ver: Pesquisa e inovação no Reino Unido: Política de acesso aberto), e as subvenções serão financiadas nesses termos. Os custos de publicação não são mais um custo elegível para bolsas do conselho de pesquisa.

Aplicam-se os requisitos de relatórios padrão de bolsas de pesquisa concedidas sob os termos e condições da bolsa UKRI.

As inscrições serão disponibilizadas a todos os financiadores; informações sobre doações financiadas serão disponibilizadas nos sites dos financiadores.

Contato

Debbie Harding

plant.bacteria@bbsrc.ukri.org